员工在公司减肥晕倒，公司是否需要赔偿需根据具体情况判断，以下是几种可能的情况：

1. 若晕倒属严重违纪情形：若公司规章制度明确规定因自身疾病晕倒导致工作中断3次以上属严重违纪，且员工已知晓该制度，同时公司能证明员工晕倒达到上述次数，则公司辞退属合法，无需支付补偿。

2. 若晕倒完全因自身疾病引发：若员工入职时隐瞒严重疾病（如心脏病），且晕倒完全因自身疾病引发（与工作无关），公司已尽合理救助义务，则无需承担主要责任。

3. 若公司未依法缴纳社保导致晕倒医疗费用无法报销：可主张公司赔偿该部分医疗损失。

4. 若公司存在违法解除合同或未履行告知义务：若公司因员工晕倒直接辞退且无证据证明其符合第三十九条情形，则属违法解除，员工可按第八十七条主张赔偿金；若公司以晕倒后无法胜任工作辞退，但未提前30日书面通知或支付1个月代通知金，则属程序违法，需额外支付代通知金（1个月工资）。

5. 若晕倒与工作有关：若员工晕倒与工作有关，例如在加班或执行工作任务时晕倒，可能符合工伤认定条件，可申请工伤认定并享受工伤待遇。

综上所述，公司是否需要赔偿需结合具体情况判断，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见。