除了户口本，证明是父子关系的方法有：出生医学证明、亲属关系证明、亲子鉴定证明、村委或居委证明、公证机关证明。

出生医学证明

如果当事人有《出生医学证明》的，可以以此来证明当事人和父亲之间，存在父子关系。

亲属关系证明

可以去要求提供该证明的单位等指定的医院或者其他具有鉴定资质的鉴定机构出具“亲子鉴定证明”来证实双方之间存在的“父子关系”。办理亲子鉴定证明时，当事人应携带双方的身份证、社保卡等，根据工作人员的提示办理相关的手续（采集血样等）。

亲子鉴定证明

可以去村或居委开出证实父子关系证明，凭证明带上户口本到户口所在地派出所出意见，加盖派出所公章就可以了。

村委或居委证明

可以到当地的户籍管理处，然后让派出所的工作人员给你开具。因为当地派出所的工作人员会通过档案去调取你们两个人之间的关系情况，然后通过这个做法能把你们两个人的关系给证明出来，然后就可以开一个盖章的证明。

公证机关证明

可以前往公安派出所，请求公安派出所在核实后依法出具相应的亲属关系证明。